Чаще всего для обогрева парников используется биологическое топливо (биотопливо), к которому относятся различные виды навоза, солома и некоторые другие органические материалы. Разлагаясь, они выделяют необходимое для растений тепло. Из навоза наилучшими качествами обладают конский и коровий навозы.

Солома используется для обогрева парников обычно в смеси с навозом. Коровий навоз, смешанный с измельченной соломой в соотношении 1:1, дает температуру на несколько градусов выше, чем навоз без примеси. Чистая солома может служить в виде биотоплива для обогрева более холодостойких культур и для выращивания поздней рассады. Чтобы разогреть солому, ее предварительно увлажняют и смешивают с минеральными удобрениями из расчета 4 кг аммиачной селитры и 1 кг суперфосфата на 100 кг сухой соломы.
Парники набивают предварительно разогретым биотопливом. Для этого на неделю раньше навоз или другие органические материалы сваливаются в кучу возле парников, не утрамбовывая. Кучу делают шириной в основании 2—3 м, высотой 1,5—2 м и произвольной длины.

Когда для обогрева парников используется смесь навоза и соломы, кучу делают из чередующихся пластов навоза и соломы. Если навоз очень влажный, прибавляют сухую солому, если сухой — солому увлажняют. Приготовленные таким образом материалы разогревают 5—10 дней.

Парник набивают в тихую и теплую погоду. Высыпанный в парниковую яму навоз размешивается вилами, ворошится, чтобы был рыхлый, и равномерно распределяется по пластам, которые легко трамбуются вилами. В середине по длине парника кладут больше навоза, чтобы при его усадке парник не опускался.

Если нужна более умеренная температура на более длительное время, навоз утрамбовывают сильнее, а для того, чтобы обогреть парник для более высокой начальной температуры — слабее.

Пласт биотоплива в котловане должен быть толщиной 50—60 см для теплых парников и 20—30 см для полутеплых.

Заправленный навоз сразу засыпают грунтом (парниковым) слоем в 10 см для рассады, пикированной в горшочках, 16—18 см для густой рассады и обыкновенной пикировки и 20 см для парниковых культур. Засыпают навозо-почвенной смесью из 1—2 частей почвы и 3 частей перепревшего навоза. К этой смеси можно прибавить и минеральные удобрения.

Набитый биотопливом и парниковой почвой парник покрывают рамами и матами. В этом виде его оставляют на несколько дней, чтобы почва прогрелась и температура стала сравнительно постоянной, после чего его можно использовать.

Боковые дорожки заполняют соломой или теплым навозом. Обогреваемый навозом парник задерживает тепло 40—60 дней.